酷派F668有一个特别之处在于它的操作系统——它没有采用当时常见的塞班系统,而是选择了Windows CE 6.0。这个选择让它在手机市场中显得与众不同。不过,这个选择也带来了一些挑战。有用户提到,第三方软件相对较少,像来电管理软件、输入法软件等都不太好安装或直接不支持安装。系统自带的字体效果也不太理想,即使通过软件设置也难以改善显示效果。另一方面,作为中国移动的定制机,F668内置了飞信、手机邮箱、号簿管家、手机证券等移动业务。这些定制应用虽然提供了便利,但有些用户觉得内置的飞信“显示效果极差”,而且一些程序容易不小心被触动,可能导致意外收费。